本实用新型涉及一种配置多个灌装机构的饮料生产系统；包括依次用管路连接的配料罐、杀菌机和灌装子系统；灌装子系统包括数目大于等于2的灌装机构；杀菌机与灌装子系统间的管路上设有一进多出的分流管件，分流管件的进口与杀菌机的出料管路连接，出口的数目与灌装子系统的灌装机构的数目相等，分流管件的出口分别与灌装机构的进料口一一对应连接；分流管件的出口与灌装机构间的管路上分别设有电动阀门；电动阀门分别与配料罐和杀菌机通讯连接，配料罐和所述杀菌机可根据所述电动阀门的开启数目确定配料速率和杀菌速率。该系统大大节约了设备的投入成本，避免了经济的损失；且操作方便，控制效果良好，提高了生产的效率和质量。