本发明涉及微生物技术领域，具体涉及一种对腹泻有治疗效果的干酪乳杆菌L.Casei21及其应用，所述干酪乳杆菌L.Casei21的分类命名为干酪乳杆菌Lactobacillus casei，保藏编号为CGMCC NO.21373，保藏日期为2020年12月14日，保藏单位为中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏单位地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号，所述干酪乳杆菌L.Casei21可用于制备治疗腹泻的产品。本发明干酪乳杆菌L.Casei21所制成的产品经服用后，菌体可通过消化道进入肠道内，抑制致病菌，并定植肠道，保持环境菌群平衡，改善腹泻症状，降低腹泻复发风险。