本实用新型中公开了一种自动化控制的细菌培养箱，包括箱体，所述箱体内设置有震荡培养装置，所述震荡培养装置包括震荡电机和震荡箱，所述震荡箱设置在震荡电机上，所述震荡箱上设置有多个夹持机构，所述夹持机构用于对培养容器的夹持固定。本实用新型中震荡培养箱上设置的夹持机构使用非常方便，并且避免培养容器在震荡过程中移动，造成培养容器之间的互相碰撞或者掉落；本实用新型中还设置有控制器，用于控制培养箱内的温度、震荡幅度和震荡频率，提高了培养箱的自动化培养水平。