本发明提供了一种内窥镜影像识别方法、电子设备及存储介质。所述内窥镜影像识别方法包括：采用第一神经网络模型，对多张原始图像分别进行多个病种类别的病种预测；基于所述多张原始图像的病种预测结果，建立所述多个病种类别的测试样本集，每个测试样本集包括预定数量原始图像的图像特征；采用第二神经网络模型，对所述多个病种类别的测试样本集分别进行病种识别；以及对所述多个病种的病种识别结果进行叠加以获得病例诊断结果，其中，所述第二神经网络模型对所述测试样本集中的多个图像特征进行加权组合以获得所述病种识别结果。该内窥镜影像识别方法对测试样本集的多个图像特征进行加权组合以提高病种识别准确度。