本实用新型具体涉及一种采样胶囊，包括外壳和设于所述外壳内的泵单元，所述外壳内设有采样仓，所述采样仓包括至少两个采样腔且采样腔通过采样口连通所述外壳外侧，以将位于所述外壳外侧的液体泵入所述采样仓内；其中，所述采样胶囊还包括设置于泵单元与采样仓之间的过渡腔，所述泵单元的出口端连通所述过渡腔，前述至少两个采样腔具有可与所述过渡腔连通的开口，至少部分所述采样腔的开口处覆盖有可在一定条件下打开所述开口的阀门。本实用新型通过阀门在一定条件下打开采样腔的开口，使得采样腔的开口分别在消化道内不同部位处于开放的状态，从而完成消化道内多个部位进行采集的目的，具有结构简单、采样方便、易于实现的优点。