一种磁控定位装置及具有其的定位系统，包括主壳体、控制单元和发射单元，主壳体具有容纳腔，容纳腔在主壳体的表面具有开口，控制单元和发射单元设置于容纳腔内；发射单元与控制单元电性连接，发射单元用于向待定位设备发射定位信号，控制单元用于驱动发射单元产生向待定位设备发射的定位信号并且用于接收处理待定位设备发送的传感数据；其中，发射单元包括多个子发射单元，每个子发射单元由控制单元独立驱动。本实用新型增加了磁控定位装置的集成度，且在做人体部位检查时，更具有针对性地驱动相应的子发射单元发射定位信号，减小装置整体功耗。