本实用新型提供了一种防结污垢的内循环厌氧反应器，包括反应器本体、酸化池管路、进水阀门、曝气池第一管路、曝气池第二管路、曝气池阀门和回流管路，通过设置出水箱，在出水箱底部连通曝气池第二管路，通过多管路进行输出，保证水流输出量的同时，依靠曝气池第二管路连通出水箱底部，保证了曝气池第二管路持续有水输出，避免出水管路与空气接触，从而造成出水管结垢现象的发生。