本实用新型提供一种水轮机主轴密封装置，涉及水轮机主轴密封技术领域，包括轴体，轴体的外表面套设有密封圈，轴体的外表面固装有安装环，轴体的外表面装有安装块，安装块的数量为两组，一组安装块的上表面转动连接有螺纹杆，螺纹杆贯穿安装环的下表面并延伸至安装环的上表面。本实用新型，通过设置轴体、密封圈、安装环、安装块、螺纹杆、伺服电机、限位杆、固定套和固定螺栓，实现了对水轮机主轴进行密封的功能，改变了水轮机主轴的密封方式，提升了密封装置的密封效果，可以防止水渗漏到机坑内，防止水淹没水导轴承，避免破坏水导轴承的工作，使得水轮机可以的安全稳定运行，避免工作事故发生。