本发明公开了一种堵头的自动装配系统和装配方法，属于自动化技术领域。该系统包括机架及其上的出料装置、两个装配装置和钢管送料装置；装配装置包括堵头下料结构、分度卡盘、卡盘压板、扩孔冲头和装配冲头；分度卡盘上均匀设有四个卡口，其每次向前旋转90°，其上侧后部的卡口与上侧前部的卡口分别为扩孔工位与装配工位；扩孔工位与装配工位上的钢管均沿左右向设置并由卡盘压板夹紧；两个扩孔冲头分别位于扩孔工位上的钢管的左右两侧且与钢管同轴；两个装配冲头分别位于装配工位上的钢管的左右两侧且与钢管同轴；两个分度卡盘同步驱动，扩孔气缸和装配气缸同步驱动。可自动化实现堵头的装配，具有省时省力、效率高和产品统一等优点。