本发明涉及数据处理技术领域，提出了一种智能矩阵式医疗清洗系统命令校验纠错方法，包括：获取操作指令及指令代码；根据操作指令获取若干操作段及操作矩阵，根据操作矩阵中的操作向量与其余操作向量的相似度以及操作向量的数量获取操作向量的特殊评价；将每个操作矩阵记为一个操作流程，根据操作流程中所有操作向量的特殊评价以及操作向量的数量获取操作流程的特殊评价；根据操作流程的特殊评价构建样本空间，并进行聚类，根据聚类结果获取异常点；根据异常点对应的操作流程与新的操作流程比对判断操作指令是否异常进行校验。本发明改进了常规命令校验通过纯文本比对所对于命令识别不充分不完全的缺陷。