本实用新型涉及水冷散热技术领域，公开了一种水道连接密封结构和水冷散热器。该水道连接密封结构包括同轴布置的柔性水管、刚性水嘴、压装螺母和柔性密封端头。其中：刚性水嘴的端部管口内壁沿轴向设置有密封段和水管连接段，密封段与柔性密封端头适配，水管连接段与柔性水管的连接端适配；柔性密封端头的内孔与柔性水管适配；压装螺母与刚性水嘴螺纹连接，压装螺母用于对位于刚性水嘴的端部管口内的柔性密封端头提供轴向挤压力。上述结构中通过柔性密封端头在软硬材料中的过渡作用，能够保证水道连接处的密封不泄漏。